溫度過高或過低均會導致棉花種（zhǒng）子發芽率下降。
土壤（rǎng）水分含量（liàng）不足，棉花種子無法吸收足夠的水分。
土壤透氣性較差，氧氣含量不足，棉花種子進行無（wú）氧呼吸並產生有毒物質，導致發芽率下降。
種子貯存時間過長，活力較差。
覆土過厚，棉花種子難以出土。
一、溫度（dù）過（guò）低（dī）或過高
1、棉花（huā）種子發芽（yá）適（shì）宜溫度為28-30℃左右，最低臨界溫（wēn）度為10.5-12℃左右，最高臨界溫度為43-45℃左右。
2、當環境溫度過（guò）低或（huò）者過高時，均會導致棉花種子的發芽率（lǜ）有所下（xià）降。據了解，當環境溫度為8℃、12℃、20℃、24-28℃時，棉花種子發芽率分別為為40-50%左右、65-75%左右、80-95%左右、85-100%左（zuǒ）右。
二（èr）、土壤（rǎng）水分不足
1、棉花種子在發芽過程中從土壤中（zhōng）吸收水分，可使（shǐ）種子體積（jī）迅速增大， 種皮變軟或破裂，同時（shí）增強通透性，從而有利於後續胚突變種皮。而當土壤水分含量不足（zú）時，會（huì）導致（zhì）棉花（huā）種子無法順利發（fā）芽。
2、棉花種子在發（fā）芽過程中需（xū）要從土壤中吸收種子本身重量60-80%左右的水分，最低臨界吸水量為種子重量52%左右。
三、氧氣（qì）含量不足
1、土壤透氣（qì）性良好，氧氣充足（zú）時，棉花種子生理活動旺盛（shèng），呼吸作用逐（zhú）漸增強（qiáng），細胞內各種（zhǒng）酶的活動急劇增強，而當氧氣不足時，棉花種子進行無（wú）氧（yǎng）呼吸，產生有毒物質，導致棉花種子不出苗、爛（làn）種。
2、土壤中的氧氣含量保持在10-21%左右（yòu）為宜。
四、種子質量問題
1、棉花種子在長（zhǎng）期貯存過程中，活力逐漸下降，導致種子發芽出苗率不理想。
2、種子在入庫貯存之（zhī）前，需要進行（háng）烘幹處理，烘幹溫度不宜超過60℃，否（fǒu）則會導致種子發芽出苗率下降。
五、覆土厚度問題
棉花種子子葉大，頂土力量較弱，出（chū）土難（nán）度較（jiào）大，一（yī）旦（dàn）覆土過厚（hòu）就會導致棉花種（zhǒng）子無法出苗。一般覆土厚度以1cm左（zuǒ）右為宜。
